Ο Χρήστος Ματσούκας έχει αποφοιτήσει από το Τμήμα Φυσικής του ΑΠΘ, ενώ έχει διδακτορικό τίτλο στην Περιβαλλοντική Επιστήμη από το Πανεπιστήμιο του Σινσιννάτι των ΗΠΑ. Τα ερευνητικά του ενδιαφέροντα είναι
πάνω στα οποία έχει δημοσιεύσει πάνω από 40 εργασίες σε διεθνή περιοδικά με κριτές, συγκεντρώνοντας πάνω από 1200 αναφορές. Από το 2005 εργάζεται στο Τμήμα Περιβάλλοντος του Πανεπιστημίου Αιγαίου, αλλά έχει εργαστεί και ως επισκέπτης καθηγητής ή επιστήμονας στο Πανεπιστήμιο Κρήτης, στη Γερμανική Μετεωρολογική Υπηρεσία και στο Γερμανικό Ινστιτούτο Μαξ Πλανκ για την Μετεωρολογία.