Ο Δρ. Μιχαήλ Φουντουλάκης είναι Επίκουρος Καθηγητής «Οικολογικής Μηχανικής και Περιβαλλοντικής Βιοτεχνολογίας» στο Τμήμα Περιβάλλοντος του Πανεπιστημίου Αιγαίου. Τα κύρια ερευνητικά του ενδιαφέροντα εστιάζουν στην διεργασία της αναερόβιας χώνευσης αποβλήτων και στην χρήση τεχνητών υγροτόπων για την επεξεργασία υγρών αποβλήτων. Έχει συμμετάσχει σε περισσότερα απο 30 διεθνή και ευρωπαικά ερευνητικά προγράμματα. Έχει δημοσιεύσει 47 άρθρα σε επιστημονικά περιοδικά με κριτές και περισσότερα απο 50 ανακοινώσεις σε επιστημονικά συνέδρια. Σύμφωνα με το Scopus, οι εργασίες του έχουν λάβει περισσότερες απο 1900 ετεροαναφορές (1.2.2022, χωρίς τις αυτοαναφορές) και ο δείκτης h-index είναι 23. Επιπλέον, έχει επιβλέψει περισσότερες απο 20 προπτυχιακές εργασίες και 5 μεταπτυχιακές εργασίες με αντικείμενα σχετικά με την αναερόβια χώνευση, τους τεχνητούς υγροτόπους και την επαναχρησιμοποίηση των αποβλήτων. Τέλος είναι επιβλέπων 3 διδακτορικών διατριβών στο Τμήμα Περιβάλλοντος του Πανεπιστημίου Αιγαίου.
Αντιπροσωπευτικές δημοσιεύσεις σε επιστημονικά περιοδικά τα τελευταία 3 χρόνια:
1. Thomaidi, V., Petousi, I., Kotsia, D., Kalogerakis, N., Fountoulakis, M.S. 2022. Use of green roofs for greywater treatment: Role of substrate, depth, plants, and recirculation. Science of the Total Environment, 2022, 807, 151004
2. Vakalis, S., Georgiou, A., Moustakas, K., Fountoulakis, M. 2022. Assessing the effect of hydrothermal treatment on the volatile solids content and the biomethane potential of common reed (phragmites australis). Bioresource Technology Reports, 2022, 17, 100923
3. Arvaniti, I., Fountoulakis, M.S. 2021. Use of a graphite-cement composite as electrode material in up-flow constructed wetland-microbial fuel cell for greywater treatment and bioelectricity generation. Journal of Environmental Chemical Engineering, 2021, 9(3), 105158
4. Zkeri, E., Iliopoulou, A., Katsara, A., ...Fountoulakis, M.S., Stasinakis, A.S. 2021. Comparing the use of a two-stage MBBR system with a methanogenic MBBR coupled with a microalgae reactor for medium-strength dairy wastewater treatment. Bioresource Technology, 2021, 323, 124629
5. Kotsia, D., Deligianni, A., Fyllas, N.M., Stasinakis, A.S., Fountoulakis, M.S. 2020. Converting treatment wetlands into “treatment gardens”: Use of ornamental plants for greywater treatment. Science of the Total Environment, 2020, 744, 140889